Бутылки заблокированы во время переноса с одного КПП на другой

45 пункт имеет 3 варианта.
"45. Оператор единой информационной системы блокирует в единой информационной системе информацию об обороте этилового спирта, алкогольной и спиртосодержащей продукции до момента устранения обстоятельств, приведших к блокировке, на основании решения уполномоченного органа, принимаемого в следующих случаях:

1) в случае поступления в отношении алкогольной продукции от правообладателя зарегистрированного товарного знака, а также изобретений и промышленных образцов, защищенных патентами, копии решения суда о неправомерном их использовании

2) в случае несоответствия алкогольной продукции, находящейся в обороте, информации, содержащейся в единой информационной системе, на основании составленного Федеральной службой по регулированию алкогольного рынка акта проверки, содержащего сведения о несоответствии алкогольной продукции, находящейся в обороте, информации об алкогольной продукции, содержащейся в единой информационной системе

3) в случае поступления от участника, указанного в абзаце четвертом подпункта 1 пункта 4 настоящих Правил, обращения об аннулировании информации, содержащейся в единой информационной системе, об алкогольной продукции, в отношении которой ранее им представлено уведомление о начале оборота."

Вам нужно написать обращение в РАР сюда. Описать подробно ситуацию, и ждать решения.
Вам предоставят доступ к старому КПП и предписание списать или переместить продукцию. Также возможно, что вам не нужно будет ничего делать, а они самостоятельно откорректируют ненужные остатки.