Кража маркированного товара

Вопрос по ЕГАИС или по Честному знаку?
   Если по ЕГАИС, то можно запросить коды маркировки с третьего регистра, отсканировать марки продукции которая есть на складе, сравнить и списать лишнее.

   Если честный знак, то зависит от того какая у вас группа товаров.

   Если это вода или молочная продукция, то используйте объемно сортовой учет и спишите по GTIN количество украденного товара.

   Если это другие группы товара, то тут все сложнее.
Списание украденного товара возможно если вы укажите код маркировки, который каким то образом найдете в списке кодов маркировки в личном кабинете честного знака.
В этом случае вам поможет инвентаризация, ее можно провести используя сторонние программы.