Честный знак вывод из оборота и списание

Документ "Списание" предназначен для кодов маркировки, которые находятся не в обороте.
Если у вас нет товара на остатке, то вы его списываете. Если товар есть, и вы с ним что то хотите сделать, то выводите из оборота.

По второй части вопроса не ясно, что у вас не получилось.
Если вы заказали перемаркировку, то после того как код перемаркировки был получен, его нужно вывести из оборота.

Я вместо вывода из оборота(товар был испорчен.утилизировали.),делала списание.можно ли это как то исправить.

На данный момент для того чтобы отменить документ нужно писать заявление в честный знак. Указать причину, по которой вы хотите документ отменить. Они заявление рассмотрят, но не факт, что документ отменят.

Вы какую причину указали в документе "вывод из оборота"? Если порча товара, то не имеет значения какой документ вы использовали в честном знаке. Потому, что нет возможности проверить когда вы утилизировали товар до того как списали его в честном знаке, или после того.

В честном знаке я делала списание (акт уничтожения). И только увидела что все списанные кизы-теперь в статусе ожидает перемаркировку

Сам документ списания проведен?
Если код маркировки выведен из оборота документом "Списание", то статус кода маркировки должен быть "Списан".
Проверьте какие причины вы указали при формировании документа "списание".
Если все указано верно, то лучше всего обратиться в техподдержку честного знака, с описанием проблемы и отправить скрины проведенного документа и статусов кодов маркировки.
Пусть разбираются, почему статус стал неверным.