Списание алкоголя без марок

Добрый день.
1. Вариант - товар продали, но за организацией числится и марка и количество. (Проверяем остатки на первом регистре и третьем регистре).
Если это так, то списываем документом "Акт списания ЕГАИС" с указанием морок на потерю. Марки берем из третьего регистра.
2. Вариант - товар продали, но марка с организации списалась, а количество нет.
В этом случае пишем письмо в ФСРАР, через службу поддержки, с просьбой убрать количество.

Спасибо, а через личный кабинет можно, в сообщениях?

Не только можно, но и нужно.
Письмо пишется в личном кабинете ФСРАР, с линию поддержки.
Указываете тему - ЕГАИС
Название - несоответствие регистра 1 и регистра 3.
В теле письма указываете позиции, по которым у вас расхождения.
Предупреждаю, обрабатываться письмо может от нескольких дней до нескольких месяцев.