Да, вы делаете всё верно. Это один из двух законных способов.

Почему так можно
По правилам маркировки упакованной воды (Постановление Правительства РФ 841 от 31.05.2021) организации, которые покупают воду для собственных нужд и не являются предприятиями общепита, не признаются участниками оборота. Им не нужно регистрироваться в Честном ЗНАКе, подключать ЭДО или как-то выводить товар из оборота.

В этом случае обязанность вывести коды из оборота лежит на поставщике то есть на вас.


Два способа оформления
1. Способ   
Документ Вывод из оборота в личном кабинете (то, что вы делаете). Покупатель не работает с ЭДО   Создать документ Вывод из оборота, указать причину Использование для собственных нужд и ИНН покупателя .
2. Способ
УПД с признаком вывода из оборота   Покупатель использует ЭДО   Оформить электронный УПД с отметкой о выводе из оборота товар выбудет автоматически при подписании документа

   Вы выбрали первый способ он полностью корректен для ситуации, когда контрагенты не хотят регистрироваться в системе.

<<<Что важно учесть
Срок: оформить вывод нужно в течение 3 рабочих дней с момента отгрузки.
Поэкземплярный учёт с 1 марта 2025 года: если вода произведена после 1 марта 2025 г., при выводе из оборота нужно указывать конкретные коды маркировки (Data Matrix), а не только GTIN и количество. Для воды, произведённой до этой даты, допустим объёмно-сортовой учёт.
ИНН покупателя указывать правильно именно так система фиксирует, кому ушла товар и что контрагент не обязан регистрироваться. >>>