Если в вашей учета есть пересчет упаковки в штуки, то в документе поступления указываете упаковку, при реализации программа сама пересчитает ее в штуки.
Если нет, тогда сами ставите в документе количество банок. назначаете им штрих код. и реализуете. то, что вам передали в УПД количество упаковок - не имеет значения, потому, что реализовывать вы будете штуки.
По идее при списании у вас будет списываться штука.
Если конечно в честном знаке будет минус, тогда нужно разбираться с честным знаком.