Учет остатков ЕГАИС

Остатки вашего склада должны совпадать с остатками ЕГАИС.
Лучше всего иметь такую систему учета, в которой вы сможете нормально отслеживать остатки ЕГАИС и поддерживать их в актуальном состоянии.

У меня возникла такая проблема. Запрашиваю остатки на первом регистре. Там они есть, а на третьем товар продан. Что делать в таком случае? Как правильно вести учёт остатков?

Это проблема остатков ЕГАИС. В этом случае вы должны написать письмо в ФСРАР, о возникшей проблеме.

У меня вопрос по программе 1С Розница. Как в ней проверять учёт остатков ЕГАИС по пиву?

Проверить остатки по пиву можно воспользовавшись встроенным приложение "Помощник корректировки остатков".
Для пива он вполне себе подойдет. однако вначале нужно обязательно провести инвентаризацию вашего склада, чтобы были актуальные остатки в вашей программе учета.

Расскажите мне как в 1С Рознице вести учёт остатков по крепкому алкоголю?

В настоящее время остатки по маркированному алкоголю учитываются по маркам. Для этого в программе 1С Розница используют документ "Остатки ЕГАИС". Запрашивая остатки по первому регистру, мы видим количество алкоголя находящееся на остатке магазина.
Количество алкоголя в ЕГАИС должно совпадать с реальным остатком товара в магазине.
Если возникают расхождения, то нужно провести помарочную инвентаризацию, и сравнить марки в магазине и марки числящиеся в ЕГАИС.
Узнать какие марки числится в ЕГАИС можно заказав отчет по третьему регистру.