Продажа маркированного товара в кредит. Касса сигма.

С этим вопросом Вам лучше обратиться в тех поддержку АТОЛ-Сигма 7.
В вашем случае нужно правильно настроить не только проверку кодов маркировки при сканировании, но и правильно отражать учет.
Если Вы реализовали товар и отдали его покупателю, то следующий чек (платеж), вы уже пробиваете без списания товара с учета. Иначе при каждом пробитии чека Вы будете продавать единицу товара.