Честный знак как принять накладную

Принимать накладные в честном знаке можно как в самом честном знаке, зайдя в личный кабинет, так и используя другие программы. Все зависит от того какую систему ЭДО вы используете. Если это ЭДО-лайт, то в этом случае подтверждаете накладную вы в самом честном знаке. Если это ЭДО стороннее, то в этом случае вы подтверждаете накладные в их личных кабинетах, а уже после подтверждения данные попадают в систему честного знака.

Можно ли настроить прямой обмен с системой честный знак. Для приёма накладной?

Прямой обмен настроить нельзя.
Можно настроить обмен с ЭДО и уже их него загружать документы полученные от поставщика.

Расскажите, как принимать накладную честного знака в системе СБИС?

Для того чтобы принимать маркированный товар честного знака в системе СБИС, потребуется подключить ЭДО.
Подключение ЭДО в системе СБИС на прием накладных бесплатное.
Теперь разберем пошагово, как принять товар.
1. Загружаем УПД в систему ЭДО СБИС.
2. Проверяем коды маркировки привязанные к УПД. Для этого в СБИС есть инструмент СБИС EDI. Он позволяет заранее сверять коды маркировки переданного товара, и сразу отправлять поставщику информацию о несоответствии. Это платный функционал, стоимость нужно уточнять у оператора СБИС. (ориентировочно от 1000 руб в год)
3. Подписываете документ ЭЦП.
На этом приемка УПД с маркированным товаром окончена.

Можете сделать инструкцию по приёмке товара в программе 1С Розница?